Здравствуйте. Есть кто разбирается в водяных насосах, а именно в его эл. части? Прилагаю фото, Нажмите для просмотра прикрепленного файла обьясните как эти 3 конца проводов соединить? Нажмите для просмотра прикрепленного файла Когда я открыл крышку и увидел, то все эти 3 конца были соединены вместе скруткой. Но изоляция в месте соединения была обуглена и стоял характерный запах короткого замыкания.

Но изоляция в месте соединения была обуглена и стоял характерный запах короткого замыкания.
Если стоит "характерный запах короткого замыкания" фраза понравилась, на хрена Вам туда соваться? Скорее всего оборудование неисправно , раз стоит запах горелой изоляции, доверьтесь специалистам, пусть они и подключают.

в этот блок попала вода и произошло замыкание.

Если попала вода в БРНО, то скорее всего она попала и в статор, включать его, эл.двигатель, без проверки не один здравомыслящий электрик не будет, необходимо разобрать эл.двигатель ,убедиться что он исправен , просушить при необходимости и включать . У Вас по фото не понятно какая обмотка "пусковая" , какая "рабочая"
Нужно замерить сопротивление . а потом уже цеплять кондёр .